苯酚和氯仿反应机理
苯酚、氯仿、异戊醇抽提DNA的原理是通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质,再加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
使用苯酚抽提细胞 DNA 时,苯酚的作用是使蛋白质变性,同时抑制了 DNase 的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与 DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相。
氯仿的作用是克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。 最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。 (酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组 DNA 时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?因为异戊醇可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡 产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含 DNA 的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
苯酚、氯仿、异戊醇抽提DNA的原理,以及这三者的作用是什么
苯酚、氯仿、异戊醇抽提DNA的原理是通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质,再加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
使用苯酚抽提细胞DNA时,苯酚的作用是使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。
氯仿的作用是克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)
用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?
因为异戊醇可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
苯酚,氯仿,异戊醇抽取DNA的原理反正是通过他们作为同分异构体的相似性质,通过有机溶剂没有办法分解。
他们反而可以使得存在于DNA的那些杂质,比如蛋白,多糖,酚类,被筛选掉。
它可以使蛋白质变性,并抑制降解,氯仿的作用是克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。,这三者的作用就是为了保护核酸不被破坏,同时能够排除掉dna以外的物质。
氯仿异戊醇别名
别名:苯酚-氯仿-异戊醇混合物
cdb溶液怎么配制
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏。
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性。
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中。
Cβ-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除基因组DNA。CTAB 4g
NaCl 16.364 g。
1M Tris-HCl 20ml( PH8.0)。。
0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌。
冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇(400ul)氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可。
cdb溶液配制方法是:
①需要量取浓硫酸10.9mL;
②配制操作可分解成如下几步,正确的操作顺序是CDBAGFE.A.用少量蒸馏水洗涤烧杯及玻璃棒,将溶液注入容量瓶中,并重复操作两次B.把已冷却的稀硫酸注入经检查不漏水的容量瓶中C.根据计算,用量筒量取一定体积的浓硫酸D.将浓硫酸沿烧杯壁慢慢注入盛有蒸馏水的小烧杯中,并不断用玻璃棒搅拌E.盖上容量瓶的塞子,振荡,摇匀F.用胶头滴管滴加蒸馏水,使溶液凹液面恰好与刻度线相切G.继续往容量瓶中小心地加蒸馏水,使液面接近刻度线.
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