5%分离胶如何配制
一般我们采用1mm厚的玻璃板制胶,将玻板固定好确认其密封,配制分离胶(也叫下层胶)约5ml,缓缓注入玻板中,然后覆盖一水层,室温静置15~20min待胶凝固;去除水层,配制浓缩胶(也叫上层胶)约2ml,最后插上1mm的梳子,室温静置20min左右。在这里值得注意的是,分离胶浓度的选择与蛋白分子量大小、目的蛋白分子量等因素密切相关。同一条件下,胶浓度越高,所需电泳时间越长。蛋白分子量小的蛋白,通常胶浓度选大一些,反之亦然。如果实验之前无法准确判断胶浓度如何选择,可以先用10%或12%的胶先做一次预实验,后续再根据实际情况优化实验条件。
配制15ml 5%的分离胶:30% Acr-Bis (29:1)-2.5ml;H2O-8.4ml;1.5M Tris-HCl( pH8.8)-3.8ml;10%SDS-150ul;10%过硫酸铵-150ul;TMED-8-15ul
浓缩胶一般是5%的浓度,不做其他浓度的调试。
分离胶与浓缩胶的成分区别
1、性质不同
浓缩胶:在不连续聚丙烯 酰胺凝胶电泳中,同一介质的凝胶浓度分为 两种,负极的加样侧一般浓度为2%〜5%。
分离胶:不连续缓冲体系聚丙烯酰胺凝胶电泳中的一部分,其组成、缓冲液pH和凝胶孔径与浓缩凝胶不同。它具有分子筛效应的小孔径凝胶。
2、过程不同
浓缩胶过程:由于浓缩胶浓度低、孔径大,分离胶浓度高,孔径小。带电蛋白质或核酸离子在大孔径凝胶中运动时,阻力小,运动速度快。当接近小孔径凝胶时,阻力较大,移动速度减慢,使样品浓缩,形成窄带,减少电泳过程中的带扩散。
怎么确定胶回收的DNA的浓度
根据你扩增的产物情况选择合适分辨率的凝胶浓度,比如:如果你的条带离引物二聚体很远,且比较单一,那可用1%~1.5%的胶即可,可稍微制厚一点,方便点样;如果你的条带只有一两百即离引物二聚体很紧或者非目标条带很多,那你需要浓度稍大一点的胶(3%~5%),电泳时间长一点,这样可使你的目的条带与非目的条带分开,方便切胶。
胶制好后即可点样,一般会使用宽一点的梳子可使上样量加大,提高回收浓度。
点完样后即可开始电泳,电泳结束后,在紫外光仪下条带可显示出来,用薄的锋利的刀片快速将目标条带切下,切胶时要注意:尽量把目标条带切下,尽量包含较少的琼脂糖胶,并切忌将非目的条带切下,还要注意尽量让紫外线照射时间短(因为紫外照射会发生核苷酸变异,产生TT二聚体)。
目标条带切下后,可使用专门的琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(很多公司都有),按照试剂盒的说明书即可回收其中的DNA。希望能帮到你,祝顺利!
不同浓度的胶怎么选择
western blot中分离胶浓度的选择取决于目的蛋白分子量
不同的分离胶浓度对不同的目的蛋白分子量的分辨率不一样,比如15%的分离胶更适合45kDa的分目的蛋白,而10%的分离胶更适合70kDa的目的蛋白
而因为western blot的膜应该是完全覆盖SDS PAGE的凝胶,所以不用太担心条带在凝胶上位置偏上活偏下
所以western blot中分离胶浓度的选择取决于目的蛋白分子量
到此,以上就是小编对于怎么算分离胶浓度大小的问题就介绍到这了,希望介绍的4点解答对大家有用,有任何问题和不懂的,欢迎各位老师在评论区讨论,给我留言。
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